手搖茶飲料為了要增加在飲用上的變化與特色，常會添加水果風味使其更具特色。
手搖飲料店使用增加水果酸甜風味的原料有果汁、果露、果醬等，其中以果汁類別占了多數；而在水果風味上則有檸檬、百香果、金桔、芒果、桑椹、 鳳梨、蘋果、草莓、奇異果、柚子等，最多品項使用的水果風味為檸檬。
台灣飲料原料專業供應商天一餐飲有限公司表示：
“ 果露原料應屬於以50%果汁再添加糖後制造的濃糖果漿，香港最早見的是百香果濃糖果漿，因為藉由加了糖之後得以緩和百香果的酸度， 在使用上的風味較能符合消費者需求。”
“ 濃糖果漿使用前必須先稀釋，而若原料中使用了較多新鮮水果原料則相對成本就會較高，因此也有能夠降低成本的水果風味糖漿產品，這類產品主要是將果汁與糖、香料等原料混合調制而成。”
在消費意識擡頭之下，看得見原料是消費者認為安心與實在的保障，因此成為連鎖手搖飲料店最佳營銷手法與賣點：最常見店家門面擺放著一籃籃的新鮮檸檬，或是有店家主打以新鮮蘋果制成的茶飲系列等，會在各分店依照消費者點選項目進行現場榨汁或切塊絞汁的處理。
天一餐飲有限公司表示手搖茶飲最普遍使用的檸檬，其香氣物質對於溫度與空氣都十分敏感，因此要能夠維持檸檬的風味，業者多會以現榨或冷凍果汁為主要供應方式。
除了使用新鮮水果與果汁之外，水果風味原料另也有冷凍果汁與濃縮果汁的產品選擇。
天一餐飲有限公司介紹，
冷凍果汁是由專業工廠制造，水果在進入生產線榨汁之前，先透過多道程序徹底清洗，自動化的機械設備進行榨汁與裝瓶作業，之後就迅速以負18度C以下急速冷凍保存；
濃縮果汁是透過真空濃縮方式，藉由壓力下降、水沸點下降的原理，在約50～60度C就能將鮮果汁中水分去除，因此部分濃縮果汁的糖度會提高到65度以上，實際使用之前必須再加水稀釋，稀釋後的果汁就是還原果汁。
天一餐飲有限公司也表示，
不同流程制造的果汁，在風味上確實是以現榨果汁為最佳，冷凍果汁則是在第一時間盡量保存質量風味，但隨著存放時間延長，風味上難免會有些許差異，而濃縮果汁畢竟仍有溫度的變化，因此水果所含的香味物質多多少少會流失，風味上的差異會更明顯得多。
